Eso si que es extraño, lo unico que se me ocurre es que los tengas mal metidos en el juego.

Los mapas tienen que estar metidos en la carpeta: "\Sof-2\base" con la extension .pk3 (no comprimidos en ningun zip ni rar), aunque  creo recordar que habia excepciones si se trataba de algun pack de mapas de algun mod en cuestion, para cuyo caso tienes que cargar primero el mod y luego te apareceran.